1.物理過濾
濾材為過濾棉（粗/細）利用濾棉中的纖維把水中的不溶性雜質、廢物阻隔下來。物理過濾是過濾系統中必不可少的一個部分，濾棉要經常換洗，能有效減少缸中有機物的含量，進而減少礦物質廢物的產出。
2.化學過濾
濾材為吸氨石、軟水樹脂、草泥丸、活性碳。利用吸氨石、軟水樹脂、草泥丸等，通過化學的方法去除可溶于水的有害物質，或調節PH值（酸堿度）；另外，活性碳運用的過濾中，雖然它起到物理的吸附作用，但針對的仍是溶于水的物質，所以在這里，認為放在化學過濾這個部分更容易理解。
3.生物過濾
濾材為玻璃環、生化球、生化棉等。運用玻璃環、生化球等濾材，提供硝化細菌良好的生長空間，得用硝化細菌的生物作用把魚類、水草新陳代謝產生的有毒廢物轉化為無毒物質，這是保持水族箱沾沾自喜穩定的環節。
4.其它作用
比如過濾的水流還能起到沖刷清潔水草葉面、促進魚兒游動鍛煉、防止水體溫度分層等。
